Флагман аргентинского виноделия: расшифрован полный геном Мальбека - шаг к улучшению качества сорта.

САН-КАРЛОС ДЕ БАРИЛОЧЕ - С помощью передовых методов биоинформатики и секвенирования ДНК экспертам Национального совета по научно-техническим исследованиям (Conicet) удалось расшифровать полный геном мальбека. Исследование, в котором также приняли участие специалисты аргентинской компании Vivero Mercier, является частью проекта Iberogen - международного консорциума, состоящего из государственных и частных учреждений Аргентины и Испании. Консорциум был создан для определения генетической и молекулярной основы соматических вариаций, возникающих у виноградных растений сортов Мальбек и Темпранильо. Эксперты отметили, что это "важное знание для получения качественного вина в условиях общего повышения глобальных температур": "На самом деле, результаты исследования имеют фундаментальное значение для создания клонов сортов винограда, которые более адаптированы к повышению глобальных температур. В частности, научной группе удалось расшифровать весь диплоидный геном Мальбека, что, по их словам, дает более четкое представление о генетическом взаимодействии между двумя родительскими сортами, Prunelard и Magdeleine Noire des Charentes. Работа опубликована в журнале Horticulture Research. "Исследование показало, что более четверти генома имеет значительные генетические вариации. Это позволило экспертам провести углубленную оценку транскриптома - активной экспрессии генов - четырех клоновых "доступов" Мальбека, каждый из которых обладает уникальными чертами состава ягод винограда. Доступ" - это уникально идентифицируемый образец семян, представляющий культивар, то есть группу отобранных растений". "Мы считаем, что это исследование дало нам ключевой инструмент для понимания биологии нашего флагманского сорта в условиях изменения климата. Объединив всю полученную геномную информацию, мы смогли расшифровать, что в геноме Мальбека содержится более 70 000 генов, которые кодируют более 88 000 белков. Это очень важно для нас, ведь теперь у нас есть инструмент, который представляет собой эталонный геном мальбека, основанный на всей полноте его геномной информации", - сказал Лусиано Кальдерон, один из исследователей Conicet, участвовавших в проекте. Помимо представления генома мальбека, ученые обнаружили дифференциальную картину экспрессии генов, которая объясняет, почему определенные клоны имеют более высокое содержание антоцианов (молекул, содержащихся в кожице винограда и отвечающих за цвет вина) и полифенолов (органических соединений, придающих вину цвет, терпкость и текстуру) в ягодах". Исследователи объяснили, что виноградные сорта размножаются клонально для сохранения их сортовых признаков. Однако генетические вариации накапливаются из-за возникновения соматических мутаций. На этот процесс оказывают антропогенное влияние транспортировка растений, клональное размножение и селекция. Именно для изучения клонально-генетического разнообразия лоз Мальбека эксперты получили данные цельногеномного повторного секвенирования четырех "доступов" с разными записями клонального размножения. "Диего Лихавецки, научный сотрудник Conicet и директор лаборатории генетики и геномики винограда Института сельскохозяйственной биологии Мендосы (IBAM, Conicet-Universidad Nacional de Cuyo), отметил: "Подобные исследования были бы невозможны без взаимодействия между научными, промышленными и производственными организациями". Руководитель научной работы добавил: "Для меня самое большое достижение этой работы - придумать проект, иметь идею и реализовать ее среди мультидисциплинарных и мультиинституциональных групп. В этом и заключается основная ценность данного исследования". Даниэль Бергамин, руководитель производства Vivero Mercier, сказал: "Многие из предложенных нами работ были бы невозможны без государственно-частного взаимодействия с академическим и научным сектором из-за времени и уровня подготовки, или же были бы слишком дороги, чтобы заниматься ими только в частном секторе". "Мальбек - это высоко ценимый сорт для производства красного вина. Он произрастает на юго-западе Франции и был выведен в Аргентине в 1850-х годах. Наибольшее количество вина из Мальбека было произведено в стране в последние два десятилетия".