Какова следующая стадия развития коронавируса, по мнению ученых?

THE NEW YORK TIMES - Крысиные экскременты из Нью-Йорка. Фекалии из собачьих парков в Висконсине. Человеческие отходы из больницы в Миссури. Вот некоторые из материалов, которые готовят нас к следующей главе в саге о коронавирусе. "За четыре года пандемии вирус утратил свою власть над телами и умами большинства людей. Но может появиться новая разновидность, способная обойти нашу иммунную защиту и сорвать с таким трудом достигнутое возвращение к нормальной жизни. Ученые по всей стране наблюдают за первыми признаками. "Мы больше не находимся в острой фазе пандемии, и я думаю, вполне объяснимо и, вероятно, положительно", что большинство людей, включая ученых, вернулись к жизни, которая была до пандемии, - сказал Джесси Блум, эволюционный биолог из Онкологического центра Фреда Хатчинсона в Сиэтле. Однако вирус все еще развивается и заражает большое количество людей", - добавил он. Блум и другие исследователи пытаются понять, как коронавирус ведет себя и эволюционирует по мере того, как население вырабатывает иммунитет". Кроме того, некоторые ученые взялись за все более сложную задачу: оценить эффективность вакцин в условиях переполненного респираторного тракта. "В интеллектуальном плане этот вирус, по крайней мере для меня, становится только интереснее", - говорит Сара Коби, эволюционный биолог из Чикагского университета, - "В некотором смысле SARS-CoV-2 стал потрясающим напоминанием о некоторых из самых глубоких вопросов в этой области, а также о том, как далеко нам еще предстоит зайти, чтобы ответить на многие из них". "Внимательный анализ новых вариантов, появляющихся в сточных водах, может помочь предсказать, какие еще формы могут появиться", - говорит Марк Джонсон, вирусолог из Университета Миссури, который искал итерации коронавируса в образцах фекалий грызунов и людей. "Они помогают нам понять эволюцию этого вируса и то, что может произойти дальше, и, возможно, даже помогут нам создать лучшую вакцину", - говорит Джонсон. Эволюционная биология когда-то была эзотерическим занятием, которое предполагало монотонные часы перед экраном компьютера. Зачастую последствия этой работы для общественного здравоохранения были весьма сомнительными. "Пандемия изменила ситуацию. Вакцины теперь можно делать легче и быстрее, чем когда-либо прежде, поэтому "понимание того, как эволюционируют вирусы, становится все более и более практически полезным", - говорит Блум. "Многие эволюционные биологи, изучающие коронавирус, включая Блума, были экспертами по гриппу, который развивает новый вариант в течение двух-восьми лет после своего ближайшего предшественника". "Ученые ожидали, что коронавирус будет вести себя аналогично. Но появился вариант omicron с десятками новых мутаций, что стало шокирующим событием, "черным лебедем", - говорит Блум. Затем появился BA. Итерации вируса, процветающие в популяции, имеют какие-то преимущества: способность обходить иммунную систему, возможно, или чрезвычайная контагиозность". У отдельного человека "нет такого эволюционного давления", - говорит Катя Коэлле, эволюционный биолог из Университета Эмори. В результате хроническая инфекция - обычно у людей с ослабленным иммунитетом - дает вирусу возможность экспериментировать с новыми форматами, позволяя ему нажать эволюционный эквивалент кнопки перемотки вперед". (Считается, что персистенция вируса в организме также играет роль в длительном развитии Ковида.)Хронические коронавирусные инфекции встречаются редко, даже среди людей с ослабленным иммунитетом. Но альфа-вариант конца 2020-х годов, омикрон-вариант конца 2021 года и BA. 2.86, впервые обнаруженный прошлым летом, появился у людей с ослабленным иммунитетом. "По словам Коэлле, некоторые мутации, приобретенные в процессе эволюции вируса, могут не принести никакой пользы или даже помешать ей. Не все версии вируса представляют широкомасштабную угрозу для населения; например, BA. 2.86, в конце концов, таковым не стал. "Однако эти генетические изменения могут предвещать будущее. "После появления BA. 2.86, детальный анализ его генома выявил момент, когда вирус все еще был чувствителен к иммунной защите организма. Джонсон предположил, что следующим шагом для вируса будет приобретение мутации в этой же точке". "И, конечно, она появилась, - сказал он, имея в виду JN. 1, вариант, на который сейчас приходится подавляющее большинство инфекций. Чем больше мы видим такие линии, как BA. Проанализировав более 20 000 образцов сточных вод со всей страны, Джонсон обнаружил менее 60 последовательностей вирусных генов, которые, скорее всего, исходят от людей с иммунодепрессией. "Такие последовательности появляются только в том случае, если "суперразмножитель" - человек, выделяющий огромное количество вируса в своих фекалиях, - живет в районе, где ведется мониторинг сточных вод". "Я уверен, что их гораздо больше", - сказал Джонсон. "Ученые, ищущие признаки новой опасности, ограничены слабым наблюдением за разновидностями коронавируса в США и других странах. "Многие страны, включая США, активизировали свои усилия по мониторингу в разгар пандемии. Но с тех пор они были сокращены, и ученым остается только догадываться о масштабах распространения респираторных вирусных инфекций". Сточные воды и госпитализация могут дать подсказки, но ни то, ни другое не является чувствительным показателем". "В США никогда не было особенно систематического наблюдения за респираторными патогенами, а теперь оно стало еще менее систематическим", - говорит Коби. "Наше понимание бремени этих патогенов, не говоря уже об их эволюции, было сильно подорвано". "Отсутствие тщательного отслеживания вирусов имеет еще одно последствие: при наличии множества респираторных вирусов, с которыми приходится бороться каждый год, теперь очень сложно оценить эффективность вакцин. До появления "Ковида" ученые рассчитывали эффективность вакцины от гриппа, сравнивая показатели вакцинации тех, у кого тест на грипп был положительным, и тех, у кого его не было. "Но теперь, с появлением "Ковида" и вакцин против респираторно-синцитиального вируса, такие расчеты уже не так просты. Пациенты приходят в клиники и больницы с похожими симптомами, и каждая вакцина предотвращает эти симптомы в разной степени". "Это становится гораздо более сложной системой профилактики", - говорит Эмили Мартин, эпидемиолог из Мичиганского университета. "Точная оценка эффективности будет иметь решающее значение для разработки вакцины на каждый сезон, а также для подготовки врачей и пациентов к тяжелому респираторному сезону". "В 2021 году, например, в Мичиганском университете произошла вспышка гриппа. В Йельском университете Акико Ивасаки и ее коллеги проверяют, может ли 15-дневный курс лечения противовирусным препаратом "Паксловид" уничтожить резервуар медленно реплицирующегося вируса в организме. "Мы надеемся добраться до корня проблемы, если это то, что вызывает заболевание", - говорит Ивасаки. Ивасаки и ее коллеги начали изучать иммунные реакции на коронавирус почти сразу после его появления. По мере развития пандемии сотрудничество становилось все более широким и международным: "И стало ясно, что у многих людей коронавирус оставляет после себя проблемы, связанные с иммунитетом". Два года назад Ивасаки предложила создать новый центр для изучения множества возникших вопросов. Инфекции многих других вирусов, бактерий и паразитов также вызывают долгосрочные осложнения, включая аутоиммунитет. "Новый виртуальный институт, открытый прошлым летом, посвящен изучению постинфекционных синдромов и стратегиям их профилактики и лечения". "До пандемии Ивасаки уже был занят изучением вирусных инфекций, имея большую лабораторию и множество проектов. Ученые часто бывают одержимы тем, над чем работают, но не с такой степенью срочности, - говорит она. Апурва Мандавилли: "Я практически работаю каждый час бодрствования".