Мнение: разница между академически правильной и неправильной геномной оценкой

Корректные геномные оценки всегда проводятся ассоциациями ангусских заводчиков каждой страны, поскольку они основаны на информации и интеграции, которые эти ассоциации имеют в своей национальной базе данных. Она состоит из трех источников информации: фенотипические данные (вес, промеры, УЗИ и оценки), генеалогические данные и генотипы. До получения геномно-обогащенных EPD каждая ассоциация самостоятельно формирует свою «референтную популяцию», в которую вносят вклад все входящие в нее заводчики. Такая популяция является «ключом», позволяющим придать значение молекулярным маркерам (SNPs), которые находятся в определенных местах на нити ДНК (основной молекуле наследственности) каждого животного. «Таким образом, ДНК может быть извлечена из волосяного покрова хвоста и генотипирована, то есть прочитана, чтобы найти определенные молекулярные маркеры, положительно или отрицательно связанные с признаками, представляющими экономический интерес: вес при рождении, легкость отела, вес при отъеме, потребление сухого вещества (DMI), остаточное потребление (RFI), послушность, конечный вес, рост, окружность мошонки, тип копыт, угол стопы и пять других признаков, которые влияют на удой и качество мяса. «Что касается нашей породы ангус, то в 2012 году мы начали формировать собственную «референтную популяцию» и с апреля 2019 года смогли перейти от классических PED к обогащенным PED путем геномной оценки, став первой ассоциацией ангусов, которой удалось добиться этого в Латинской Америке. Важно отметить, что это было сделано в соответствии с академическими протоколами Американской ассоциации ангусов, Австралийского общества ангусов, Новозеландской ассоциации ангусов, Канадской ассоциации ангусов и других международных ассоциаций. Важно также отметить, что после завершения проекта по созданию генома человека в 2003 году был запущен проект по созданию генома крупного рогатого скота с инвестициями в размере 50 000 000 долларов США в Медицинском колледже Бэйлора (Техас, США), что в настоящее время позволяет применять описанную выше геномную оценку. «В 2019 году наша ассоциация подписала соглашение с крупнейшей в мире лабораторией Neogen (Линкольн, штат Небраска, США), в которую отправляются образцы ДНК (волосяные луковицы или кровь) для выделения ДНК и генотипирования с помощью специального чипа высокой плотности (75K), разработанного для породы ангус, под названием AngusGS. «Эти генотипы передаются в ассоциацию, и отдел оценки рассчитывает обогащенные PED на основе нашей собственной референтной популяции, состоящей из всех фенотипических данных (вес, промеры, УЗИ и оценка), генеалогических связей и 26 630 генотипов, которые у нас есть на данный момент. Геномная оценка не только имеет преимущество ранней первичной оценки с использованием трех вышеупомянутых источников информации, но и оказывает большое влияние на те признаки, которые трудно измерить, например, на эффективность конверсии. В этом отношении наша программа E.R.A. Наконец, важно отметить, что некоторые частные компании утверждают, что проводят геномные оценки для заводчиков породы ангус или других пород, но не указывают, что используемая ими референтная популяция не принадлежит ни одной ассоциации заводчиков. Например, это не Американская ассоциация ангусов, а частная популяция тех компаний, которые используют несколько мясных пород». Более того, они не используют и не запрашивают никаких фенотипических данных (вес, промеры, УЗИ или баллы) и не включают никакой племенной информации. Таким образом, это отличный пример некорректных сравнений и неправильного использования источников правильной геномной оценки. Вы можете проконсультироваться с доктором Дэном Мозером (Университет штата Канзас, США), доктором Стивом Миллером (Университет Новой Англии, Австралия) и доктором Келли Реталлик (Американская ассоциация ангусов, США). Автор является президентом Аргентинской ассоциации ангусов».