Консорциум с ICMBio создаст 5000 геномов для сохранения видов

Институт сохранения биоразнообразия имени Чико Мендеса (ICMBio) и Технологический институт Вейла (ITV) приступили к реализации проекта "Геномика биоразнообразия Бразилии", в рамках которого генетика будет использоваться для сохранения видов бразильской флоры и фауны. Проект, отличающийся своей масштабностью, рассчитан на пять лет и предполагает на первом этапе получить 5000 геномов, выделив в качестве приоритетных виды, находящиеся под наибольшим риском или уже включенные в национальные планы сохранения. Генетическое секвенирование - это метод молекулярной биологии, позволяющий идентифицировать азотистые основания в генетическом материале. Когда специалисты располагают геномными данными, они могут использовать их для прогнозирования угроз и мониторинга видов во времени и в разных местах. В случае с человеком секвенирование ДНК позволило, например, применить полученные знания для производства лекарств и т.д. Для реализации первого этапа был сформирован управляющий комитет, ответственность за работу которого разделяют ICMBio и ITV, а также пять специалистов, роль которых будет заключаться в координации плана работ, и рабочая группа. Всего в работе комитета примут участие 20 исследователей ITV и более 30 специалистов из исследовательской и природоохранной сети ICMBio, а также аналитики из федеральных природоохранных подразделений. После первой встречи, состоявшейся в последнюю неделю сентября, каждой исследовательской организации было поручено продумать кандидатуры академических партнеров. В качестве отправной точки команда определила список из 80 видов, для которых генетическое секвенирование будет проводиться более детально, т.е. которые станут эталонными геномами и, следовательно, потребуют больше времени и средств. Исследователь Александр Алейшо, координирующий проект для ITV, отмечает, что секвенирование в Бразилии стоит в три раза дороже, чем в странах Северного полушария. В презентации для журналистов, проведенной в начале этого месяца, Алейксо продемонстрировал таблицу, иллюстрирующую широту и уровень амбициозности проекта: в ней перечислены США, Китай, Великобритания, Норвегия и Германия как страны, обладающие наибольшим количеством данных о геномах беспозвоночных, которые уже были секвенированы. На втором месте также находится международный консорциум с 109 уже собранными геномами, уступая лишь США, у которых их 200. Алейксо отмечает, что с самого начала инициатива была задумана в виде партнерства с ICMBio, учитывая роль, которую играет эта организация. "Вполне вероятно, что в ходе реализации проекта ICMBio предъявит дополнительные требования к эталонным геномам. Поэтому пока невозможно определить, сколько будет эталонных геномов", - пояснил исследователь, возглавляющий группу экологической геномики в ITV и назвавший этот проект осуществлением "большой мечты". Аналитик-эколог Амели Бранкиньо Мартинс, одна из ответственных за проект от имени ICMBio, рассказала агентству Agência Brasil, что одним из удовлетворений ее коллег было осознание того, что институт уже следовал этому предложению и что, когда его спрашивали, у него были хорошо разработанные опросы для руководства проектом. "Неожиданностью стала способность института выявить очень большое количество проектов. Только по референсным геномам ICMBio указал 278 видов, которые могут стать объектом немедленных действий", - сказала она в интервью Report. По словам Амели, были выделены как более известные виды, такие как ягуар, уксусная собака, мурику и паукообразные обезьяны, так и другие, не столь известные. "Один из проектов, который мы могли бы использовать, - это грызун, мышь, которая является эндемиком Бразилии. Ее название Juscelinomys, она не встречалась с 1960-х годов и была зарегистрирована во время строительства Бразилиа. Был собран один экземпляр, который больше не встречался. Поэтому мы не знаем, вымер ли этот вид или его просто не смогли найти. Идея заключается в том, что в рамках этого проекта мы сможем создать молекулярные маркеры и искать этот вид, используя образцы почвы, воды и воздуха, чтобы определить, вымер ли он или его еще можно найти, чтобы сохранить. "Исследовательский проект может также взять на себя миссию изучения новых видов, таких как виды, обитающие в пещерах Бразилии, которые, по словам аналитика, остаются без внимания. "Мы даже не знаем о разнообразии видов, обитающих в пещерах страны. Поэтому проект может помочь нам познакомиться с их богатством". "Другой пример - ривулиды, которые известны как облачные рыбы. Существуют виды ривулид, находящиеся под угрозой исчезновения. В бассейне реки Сан-Франциско нам необходимо создать безопасную популяцию в неволе, поскольку они находятся под высоким риском исчезновения. Нам необходимо знать генетическое разнообразие, чтобы сохранить его, если мы будем работать в неволе, с целью сохранения вида в дикой природе", - говорит Амели. По ее мнению, в рамках проекта следует также уделить внимание беспозвоночным, таким как пчелы, плодовые бабочки и другие насекомые-опылители, которые важны для процессов лесовосстановления, а также амфибиям и рептилиям.